Mehanizem polimerizacije v SDS gel

SDS- PAGE jepostopek znanstveniki uporabljajo za ločevanje proteinov , ki temelji na tem, kako se selijo z gelom . Geli so iz polimera imenovano poliakrilamid . Ko bo poliakrilamidni gel , začnete z mešanico kemikalij : akrilamid, bisakrilamida , SDS in varovalni kemikalije za stabilizacijo pH. Dodajanje Persulfate spojino in drugo kemikalijo , imenovano TEMED bo povzročiloakrilamida tvorijo dolge verige ali polimerizira . Začetek

persulfat ion v amonijev persulfat jeenakovredno dvema sulfatnih ionov, povezani s šibkim kisik-kisik vezi . Ta vez je lahko cepijo ali odmor v dveh, kar je dalo sulfata radikale — zelo reaktivne molekule z neparnimi elektroni . Sulfat ostanek lahko reagira z vodo, da se ustvarihidroksi ostanek , ali pa lahko reagira z akrilamid monomera začeti polimerizacijske reakcije . TEMED deluje kot katalizator , ki pospešuje hitrost, s katero Persulfate ioni tvorijo radikale.
Chain Reaction

Kohidroksilna ali sulfat radikal je oblikovala , ko napade akrilamidnega monomera , pri čemer je eden od elektronov v dvojno vez. Akrilamida monomer je zdajradikalno z neparnimi elektroni , tako da gre za napad še akrilamida monomera na podoben način . Ta niz dogodkov, ustvarja hitro rastoči verigo akrilamida monomerov povezanih z enojnimi vezmi . Verižna reakcija se konča šele, ko sta radikali reagirajo s seboj .
Zamrežljivega

Če so bili prisotni na lastno akrilamida, ki bi ne tvorijo debel gel , kar potrebujete za SDS- PAGE. Polimeri biti zamrežen , da se tvori gel, s pravimi lastnostmi , in da je, če bisakrilamida pride noter dvojne vezi v bisakrilamida služijo tudi kot tarče za radikalov v reakciji , in ker ima dve mesti , kjer se lahko napadla radikalov , to je na koncu vključiti v dveh rastočih polimerov . Zato so polimeri na koncu z zamreženju med njimi na naključnih mestih vzdolž dolžine vsakega verige.
Premisleki

polimerizacije reakcija je zelo hitra , tako da, ko ti ” sem dodal TEMED in persulfat , bo potekala zelo hitro . Čistost vaših reagentov je pomembno, saj se lahko zgodi, vplivajo na rezultate . Akrilne kisline , na primer , lahko dodamo polimera in ustvarja ionsko-izmenjalne strani, ki lahko povzroči lokalno nihanja pH v svojem gela . Nastalo gel še vedno lahko vsebuje nekaj akrilamida monomera in akrilamida jenevrotoksin , tako da vedno sprejeti ustrezne varnostne ukrepe pri delu z geli SDS .